linux vs windows y el cubase

hola, soy nuevo en el mundo de la informatica musical, podria alguien ayudarme? si en un mismo ordenador esta instalado linux para internet y descargas y windows xp profesional para cubase puede esto de alguna manera influir en el funcionamiento del mismo? porque el cubase cada vez que lo abro hace cosas diferentes, no suena o no graba o no las dos cosas, o aveces hace todo y se cuelga... podria alguien ayudarme? Gracias!!