.. Hola ... '' SI '' es posible dependiendo de tu placa de sonido , tenes que ir al panel de efectos y configurar en un canal vacio del mismo, la entrada de audio de tu placa de sonido.
Para grabar en tiempo real con el FL primero necesitas saber que tipo de driver tiene tu tarjeta de sonido, ya que si se maneja a traves de DirectSound (DS) no podrás grabar directamente con el FL...

Si por ejemplo es un driver Asio, tienes mas opciones, lo primero que tienes que hacer es en el Mixer de FX(F9), en la esquina superior izquierda abre el menú llamado Effects option, hay te vas a la opción que dice Disk recording, ahi te recomiendo que estén habilitadas la opciones Auto-create audio track y Latency compensation...

Después en el mismo Mixer de FX seleccionas un canal vacío, ahi en el mixer en la esquina inferior izquierda donde dice IN, tienes que seleccionar la entrada de grabación, dependiendo de tu tarjeta de audio, aparecen varias opciones... Después de seleccionar la entrada en un canal vacío, en la esquina inferior derecha del mixer aparece un ícono en forma de disquete que dice REC, lo activas...

Después en el Playlist, si quieres grabar en tiempo real mientras escuchas lo que hay en la canción, activas la función Song mode... luego oprimes la tecla R y luego le das play a la canción y comienza la grabación...

Eso es basicamente todo, después de grabar automaticamente se crea un Audio Clip, y aparece dibujado en el Playlist...