Para bajar audio si es un instrumento virtual dentro de logic o cubase, es mejor exportar a audio la pista (bounce o mixdown), y importarla nuevamente, de lo contrario vas a perder calidad por el cambio de D/A A/D, salvo que salgas y entres en forma digital mediante ADAT, TDIF, SPDIF o cualquier norma digital con un mixer digital.

Una vez con el audio podes aplicar lo que quieras.

Y FX para MIDI si hay emiliano depende que efecto quieras aplicarle, hay muchos sequencers que tienen Shuffle, compresion etc, no vas a logar un efecto raro pero podes jugar con las velocidades paneo etc.

Si es un modulo/sinte/teclado externo vas a tener que grabar como te dice metamorfina.