La explicación , puede llegar a ser que , al tener el disco tan lleno , posiblemente tenga muchisimas direcciones de memoria por cualquier lado . Y tal vez un solo sample lo tenga guardado en direcciones de memoria diferente , entonces llega un momento que de andar a los saltos el porcesador se satura de instrucciones y larga el pico.
Lo mas recomentable , seria que formatee e instale todo devuelta .
Si no , podrías pasarle un defragmentador de disco y posiblemente se solucione
Igualmente es recomendable que dejes algun gb mas libre.
6 o 7 gb esta bien, en un disco de 40